Als zentrale Einrichtung der Universität Augsburg ist das ZWW der Universitätsleitung zugeordnet und wird von einem Leitungsgremium geleitet.
Das Leitungsgremium entscheidet über alle grundsätzlichen Angelegenheiten des ZWW, vertritt dieses gegenüber den Organen der Universität und trägt Sorge dafür, dass das ZWW seine Aufgaben ordnungsgemäß erfüllt.
Das Leitungsgremium besteht aus fünf Hochschullehrern oder Hochschullehrerinnen der Universität Augsburg. Ein Vizepräsident oder eine Vizepräsidentin, ein Dekan oder die Dekanin sowie der Geschäftsführer oder die Geschäftsführerin wirken mit beratender Stimme mit (vgl. die „Ordnung für das Zentrum für Weiterbildung und Wissenstransfer der Universität Augsburg“, erlassen am 24.11.2016).